تضم المجموعة الثانية من مشروع المكتبة الرقمية مجموعةً من أندر مخطوطات مجموعة التراث الإسلامي بمسجد العارف بالله أبي العباس المرسي، إذ تضم: الإصلاح والإيضاح لابن كمال باشا، ديوان الأريب عن كتب الأعاريب للسامولي، خلاصة الحساب للعاملي، تلخيص البيان عن مجازات القرآن للشريف الرضي، مجموعة رسائل في الأسطرلاب لعدة مؤلفين، جامع المسانيد والألقاب لابن الجوزي، مقالة في علم الهيئة لابن الهيثم.
وهو من إصدارات مركز ومتحف المخطوطات.