A型流感病毒在很多动物中都被发现，包括鸭，鸡，猪，鲸鱼，马，海豹

有16种血细胞凝集素类型，9种神经氨酸酶类型，所有的这些类型都可以在野生禽类的A型流感病毒中发现

野生禽类是A型流感病毒所有亚型的主要自然储库，被认为是其他动物A型流感病毒的来源。

大多数流感病毒引起禽类无症状或轻微感染；然而，禽类症状的程度因病毒株不同而差异巨大。在一些种类的野生禽类特别是家禽，例如鸡和火鸡等，被一些A型流感病毒（例如，一些H5和H7种类的病毒）感染可能引起广泛的疾病以及死亡。

猪可以被人、禽流感病毒感染，也可以被猪流感病毒感染。感染的猪可以出现与人类相似的症状，例如咳嗽、感冒和流涕。

因为猪对禽、人和猪流感病毒都具有易感性，所以他们很可能被不同来源（例如鸭、人）的病毒所同时感染。如果发生了同时感染，很有可能这些病毒的基因发生混合并产生新的病毒。