据国家疾病控制中心报道，1999年全美国共有659，441例衣原体感染。美国女性人群中的衣原体感染率由1987年的每10万人78.5次上升到1999年的404.5次。这种感染率的上升可能表示衣原体筛查率的提高，检测手段的更加灵敏，也可能与报告的改进和持续高水平的疾病负担有关。（衣原体预防和监控计划，国家疾病控制中心，2000年11月。）

由于筛查点大多针对女性检验，所以男性人群的衣原体感染率并没有报告。许多卫生服务提供者会使用抗生素治疗那些有尿道分泌物和排尿烧灼感的男性，他们往往被诊断为尿道炎。这些抗生素可以治愈衣原体感染，所以并没有进行针对男性的检测和报告。