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进一步的检测，包括抗原检测：
  
    在一次新的病毒疾病的开始或爆发的开始，用病毒分离的方法得出病毒进一步的特征和与其他病毒进行的比较。如口蹄疫病毒或马的流感病毒。
    现在一些比较新的检测方法包括检测病毒的核酸。
    当活体动物体内含有的病毒对于通常方便的血样或粪便样本太少的话经常会用抗体检测。
    例如猫的免疫缺陷病毒和猫的传染性腹膜炎病毒就要用ELISA来检测血液中的抗体。
    抗体检测用来测定一个动物在发病到疾病恢复两周后之间是否产生一种特定病毒的抗体。如从带有马疱疹或流感病毒的咳嗽的马体内双份的抗体样本。