インフルエンザウイルスにはA型、B型、C型の3種類があり、それを区別するのは内部抗原と呼ばれる M1タンパク、NP タンパクです。

各種類のすべてのM1蛋白は交差抗原性を示します。各種類のNP蛋白も交差抗原性を示します。

表面抗原と呼ばれるHA、NAにはさまざまなタイプがあり、それぞれのタイプ、系統で独自の抗原を持っています。

これらにより、ある種のA型インフルエンザが爆発的流行を起こす可能性があるかどうかがわかります。

インフルエンザウイルスの系統は、ヘマグルチニンとノイラミニダーゼという表面のタンパクにより決められます。例えばtype-3のヘマグルチニンとtype-2のノイラミニダーゼを持てばH3N2のように呼ばれます。

もし二つの異なるタイプのインフルエンザウイルスが同じ細胞に同時に感染したら、 protein capsids and lipid envelopes が外れ、ウイルスのRNAが露出し、 mRNAとなります。もし二つの異なるインフルエンザウイルスが同じ細胞に同時に感染したら、カプシド蛋白とエンベロープが外れ、mRNAに転写されるRNAが露出します。

感染した細胞は抗原が組み合わさった新しいウイルスを生み出します。例えばH3N2 とH5N1が出会うと、 H5N2になったりします。

人間の免疫システムは新しいタイプのインフルエンザウイルスを認識できないので、極めて重大な脅威となる可能性があります。