يُركز مركز دراسات الإسكندرية وحضارة البحر المتوسط على البحث عن تراث الإسكندرية والبحر المتوسط المادي والمعنوي وتوثيقه؛ وذلك بهدف دعم الحوار والتبادل في المنطقة. ويسعى المركز إلى الحفاظ على التطورات القديمة لمدينة الإسكندرية، ودعم التنمية المستقبلية عن طريق إجراء الأبحاث وإقامة المؤتمرات والمعارض.
وينظم المركز عمل اللجان التي شكلها المحافظ لتحديد المباني التاريخية. وقد أنتجت الخرائط الإلكترونية وقواعد البيانات الخاصة بالمباني والشوارع والأحياء السكنية والأعمال الفنية من خلال نظم المعلومات الجغرافية. وتمت الموافقة على كتالوج التراث السكندري بناءً على القرار رقم ٢٧٨ لسنة ٢٠٠٨ الصادر في ٣١ يناير ٢٠٠٨.
يهتم المركز أيضًا بالتنمية العمرانية؛ حيث يدعم جهود محافظة الإسكندرية في البحث وكتابة تقارير مفصلة عن أهم معالم البيئة السكندرية، مثل: الإسكان والصناعة والسياحة والتخطيط والتوزيع العمراني والقضايا البيئية والزراعة.
ولمركز دراسات الإسكندرية والبحر المتوسط برنامج نشر نشط يغطي مجالات متعددة، ويصل إلى جمهور عريض من الباحثين والعامة على حدٍّ سواء. وتركز الدراسات الصادرة عن المركز على موضوعات متعلقة بالإسكندرية؛ من تاريخ وثقافة ومجتمع، كما تتضمن مذكرات وسيرًا ذاتية لأشخاص ارتبطوا بالمدينة. وقد أصدر المركز أيضًا كتبًا عن تاريخ السينما في الإسكندرية، وتراثها الشفهي، وكذلك عن المطبخ السكندري.
وتُوثق المجلة الدورية للمركز أخباره وأنشطته، بجانب مقالات متعددة تغطي موضوعات متعلقة بالإسكندرية ومنطقة البحر المتوسط؛ حيث يضم التصميم الجذاب للنشرة الإلكترونية جوانب مختلفة للمدينة وشعبها في الماضي والحاضر للقراء في الداخل والخارج.