二十面体丙酮酸脱氢酶复合体的截面模型，来自于对嗜热脂肪芽孢杆菌（Bacillus stearothermophilus） E1E2亚复合体的低温电子显微镜分析。60个E2分子中的3个（红色、绿色、黄色）被标识出来。E2的lipoyl结构域在环形区域内，于E2分子内核（青色）与60个E1分子（紫色）之间运动。目前考虑这种运动可能是复合体活性位点的重要作用机制。丙酮酸脱氢酶复合体是细胞能量调节的重要组成部分，调节丙酮酸的氧化脱羧过程，产生aceCoA，联系着糖酵解与三羧酸循环两大代谢途径。