淀粉样蛋白斑块是不溶性的β-淀粉样蛋白沉积物，是从一个更大的蛋白质（淀粉样蛋白的前体蛋白APP）上剪切下来的一种蛋白质。尽管研究者还不能确定这些斑块到底是AD的副产物还是导致AD的原因，但是APP的结构改变能够导致AD已经为大家所知。

科学研究的焦点现在集中于防止β-淀粉样蛋白的形成或者抑制它沉积形成不溶性的斑块。两个其他的蛋白分子，早老素1和早老素2可能与实际的APP剪切生成β-淀粉样蛋白，应激相关的细胞死亡，神经递质穿过神经元之间的微小的间隙－突触的能力有关。位于三个不同染色体上的这三种基因的突变几乎可以解释所有的家族性AD病例。