Unutrašnji antigeni (M1 i NP proteini) su tip-specifični proteini (tip-specifični antigeni) koji se koriste u determinisanju posebnih virusa A, B ili C. M1 proteini svih tipova pokazuju unakrsnu reaktivnost. NP proteini svakog tipa također pokazuju unakrsnu reaktivnost.

Površni antigeni (HA i NA) pokazuju velike varijacije karakterstične za podtipove i specifične antigene virusa. To se koristi za identifikaciju posebnih podtipova gripe A koji su odgovorni za epidemiju.

Podtipovi gripe se imenuju prema tipovima hemaglutinin- i neuraminadaza- proteinskih antigena, pa se tako može na primjer nazvati  H3N2 za tip-3 hemaglutinini i tip-2 neuraminidase. 

Ako dva ili više podtipova gripe ificiraju iste stanice istovremeno, njihovi proteini i lipidna membrana se miješaju (kombinuju) i izložena RNA se transkripcijom prevodi u mRNA.

Stanice domaćina u tom slučaju formiraju novi virus koji kombinuje antigene; npr., na taj način H3N2 i H5N1 mogu graditi oblik H5N2 .

Zato čovjekov imunološki sistem ne može da prepozna ovaj novi podtip influence i on postaje ekstremno opasan.