虽然中药总的来说是安全且有效的，但人们却发现有一些会产生有害的效果。由于人们对中药的质量和安全性大都不作检查，吃药时就会有各种风险ЧЧ比如吃到假药，药品间产生反应，以及药中可能含有有毒的污染物等。错误的或者带有误导性的标签也是开架贩售的中药的问题所在。一些诊所甚至不能正确辨别中药的种类和准确地掌握使用剂量。

中国的专利药物一般都含有许多活泼的成分，包括占首要地位的草药，动物身体的一部分以及矿物质。专利产品通常都被制作成片剂，胶囊，粉末或者液体状以便服用。重金属或者一些未经批准加入的成分可能在这些制作过程中掺入进去，有的时候这些搀杂物可以促进或者加速治疗。

砷，钙，铅和汞是在一些中药中常见的重金属。这些污染物可能源于种植过程中使用的杀虫剂，土壤或者大量加工植物时使用的作业机器。在那些治疗气喘、背痛或者关节炎等病的中药中人们还发现了氨基比林，咖啡因，布洛芬等。