В семейство Pseudomonadaceae были включены роды Pseudomonas, Xanthomonas, Frateuria и Zooglila. В 1992 году P. cepacia (Palleroni and Holmes, 1981) [39], а также 6 других видов, принадлежавших ко II рРНК-группе рода Pseudomonas (P. solanacearum, P. pickettii, P. gladioli, P. mallei, P. pseudomallei, P. caryophylli) [38] были отнесены к новому роду Burkholderia [55]. В отличие от рода Pseudomonas, род Burkholderia принадлежит к B-субклассу типа Proteobacteria [25].