Desde el inicio de este programa, se han desarrollado instrumentos (sistemas de registro) y herramientas para procesamiento (software) de aplicación en diferentes áreas. A modo de ejemplo, el Programa ha implementando instrumentos únicos de registro en salud materna, del niño y del adolescente. De la misma manera se dispone de herramientas informáticas para el procesamiento de dicha información a nivel local.

Dentro de los desarrollos realizados por el Programa Materno Infantil sobre la base de utilitarios en Epi Info caben citar, entre otros a: NUTRI para antropometría de niños y embarazadas, LACMAT para análisis de prácticas de lactancia materna para uso a nivel local, regional y estatal, SIPA para análisis de atención pre y post natal para ser utilizado por trabajadores de salud en el primer nivel de atención (obstétricas y médicos).