Мутации могли быть сопутствующим феноменом, возникшим в результате отсутствия селективного давления и отсутствия необходимости осуществлять сборку инфекционных вирусных частиц. Последнее предположение поддерживают следующие два наблюдения: 1) показано, что инактивация функции М-гена в процессе гипермутации наблюдается при коревой энцефалите с включениями. 2) был обнаружен интенсивный генетический дрейф в различных направлениях у 3-х персистирующих вирусов, ассоциированных с ПСПЭ.